教会作基督的身体是神人一体的联合，即一个可见与不可见实体的结合。教会的不可见方面，指上帝与人之间的共融，以上帝圣三的三位之间的共融作为模范。随著天使被造，天上的教会设立；以後，人又加入这教会：“然而你们却接近了熙雍山和永生上帝的城，天上的耶路撒冷，接近了千万天使的盛会，和那些已被登录在天上的首生者的集会，接近了审判众人的上帝，接近 了已获得成全的义人的灵魂，”（希十二22-23）。
人的堕落毁坏了他和天上教会的共融。不过，上帝并没有放弃他的被造物，却在万世之前前就为人的拯救作好计划。为了预备人回归与上帝共融，他拣选“以色列选民”用以预示新以色列，就是教会（罗九7-8；迦三29）。
保禄宗徒说到存在于万世之前的上帝的奥秘，以上帝子及圣言降生成人，向人和天使启示。这是被上帝隐藏了许多世代的奥秘的组织…因为上帝的各样智慧，按照永恒的计划，藉著我们的主耶稣基督…如今又藉著教会显明了（弗三9-11；参西一26）。
教会在基督耶稣里重新设立；天使和人按序联合重建教会：
“基督啊，藉著你的十字架，
天使和人类进入同一羊群，
成为同一教会。
天地同欢。
主啊，愿荣耀归于你。”
教会身体的合一由一位元首基督付之实现；“因为丈夫是妻子的头，如同基督是教会的头，他又是这身体的救主”（弗五23）。上帝与人的联合有著绝对和纯粹的特征：因此旧约称上帝为忌邪的上帝（出二十5；申五9）。人背道则被描述为犯奸淫（民二17；则六9）。
在教会内“重新聚集”，即上帝四散的子民聚集一起（若十一52）得以完成，众人在元首基督之下构成一个身体，基督是这身体的救主。基督“爱了教会，并为她舍弃了自己，以水洗，藉言语，来洁净她，圣化她，好使她在自己面前呈现为一个光耀的教会，没有瑕疵，没有皱纹，或其他类似的缺陷；而使她成为圣洁和没有污点的。”（弗五23-27）。
“以水洗，藉言语”即“因父及子及圣灵之名”（玛二十八19），我们成为圣洁，进入以基督为首的身体内，“在基督耶稣内已成了一个”（迦三26-28）。因此，我们说到教会的时候，不只表示是没有基督、没有主为首、没有身体的上帝的子民而已。我们指的是既有教会的元首，也有所有的成员基督徒在内。圣灵在五旬节那一天降临教会，住在她里面，复兴信徒，将他们并入一个基督身体之内。基督“在众多弟兄中作长子”（罗八29）；藉著他，我们与上帝和好（格後五18；哥一18-20）。
我们于是可以明白，教会作为基督的身体，被视为与救恩同等。在她里面，基督与父的关系传递给我们每一个人：我在他们内，你在我内，使他们完全合而为一”（若十七23）。教会不是使人获得救恩的工厂，而是救恩本身。上帝四散的子民“聚集”，而与基督“联合”不是次要的事实，而正是拯救事件（若十一52）。人不能不与基督的身体联合就可以作基督徒，或者自称为基督徒，同时又不和众弟兄相共融（格前十二12-28）。每一个人自己的得救，不能以为和别人无关，也不能据以不加入教会，不溶入教会生活。一个“爱自己”的人陷入自我陶醉，希望不必求诸于耶稣基督，不必加入他的身体而自己寻求得救，不能视为是基督徒。
教会作为基督的身体，只有一个（弗四4），基督是不“分裂”的（格前一13）；一个人不和弟兄们在一起，不能说是属于“基督的”。因此，分离或分裂是犯罪。
基督徒的集会或聚集不只是一群基督徒聚在一起，而在表达同一基督身体的联合，即：身体与头合在一起。这就是为什么只要有两三个人在一起，就有基督同在的原因，也就是一个完整的大公教会。不过，他们必须奉基督的名聚会（玛十八20）。
这表示如此的集会必须在基督的灵里实行，好奉行基督的工作，而不是奉基督的名为人的目标服务。基督的工作是将上帝四散的子民聚集“归一”；在以圣体血圣事表示合一而非分离之时，这合一就完成了。保禄宗徒提到这些聚集是“奉基督的名”时如此宣告：“这是我从主所领受的，我也传授给你们了：主耶稣在 被交付的那一夜…说…”（格前十一23）。
圣保禄在其他地方强调说：“肢体虽然众多，身体却只是一个”，因此将圣体血圣事视为人归回“同一本原”的合一，朝向“在基督内归于一”的合一。
因此，聚会虽然只有两三个人，仍必须表达大公教会的合一，而不是分裂成不相共融的小群和小派。如此宗徒教会的合一甚至延伸到凡物公用的程度：“众信徒都是一心一意，凡各人所有的，没有人说是自己的，都归公用…”（宗四32）。在这样一个“奉基督的名”的聚集里，没有分离和分裂的容身之地。由于这原因，宗徒责备格林多人，因为他们在教会聚集时竟然发生分裂：“…我听说你们聚会时，你们中间有分裂的事…”（格前十一18）。于是，在构成分裂或作秘密小集会的时候，“两三个人”是不能奉基督的名集会的，即使那些聚会的人辩称自己是“奉基督的名”也在所不许。
另外，教会有其可见的一面。耶稣基督亲自拣选十二门徒，称他们为宗徒。在他于荣耀中升天之前，他应许他们“佩戴上自高逃邙来的能力”（路二十四49；宗一8）。他又差遣他们出去宣扬上帝的国度，叫相信的人成为门徒，藉著圣洗圣事将他们并入教会（玛二十八19）。这应许在五旬节那一天得到应验，教会增加了三千人（宗二41）。
这第一所教会是个具体的团体和，包括效法基督的神圣德行（格前十一1），
在主日举行圣体血圣事，遵守宗徒的教训（宗徒训诲录），以及我们所已经提到的公众祈祷和爱德的共融，甚至达到财物共用的程度（宗二42；四32）。凡是参加如此集会的人包括在基督徒之中。没有参加的不能被视为基督徒。宗徒教会存在著特殊的架构：宗徒、长老（司祭）、执事（辅祭）、以及如弟茂德，弟铎等核心干部。当有关信仰的严重问题发生时，就要在圣灵引导之下召开扩大议会予以解决，如宗徒议会就等于是教会的“喉舌”或教会之声（宗十五22-29；参弟前三15）。圣经所说的教会是可见的，具体的。教友中间有许多是很软弱的，灵性上犯严重错误的，必须要求他们悔改以免被革除出教会（玛十三30、47；格前五1；犹12、23）。
对于任何宣称“从不洁净中分别出洁净”将在末世的时候发生，从而组织所谓“洁净教会”的理论，正教教会予以谴责，因为在主再临前，没有人能作如此的分别。像此类的个案，判断的标准显属人为，其评估易犯错误（玛十三29-30）。
教会里有软弱教友的事实，并不表示整个教会都堕落背道。当梅瑟上山向上帝说话的时候，几乎全体“选民”都堕落背道叛教，然而上帝依旧保全他的子民，并没有弃绝他们（出三十二1-8）。
新约的教会，上帝的新子民，不只是发生于宗徒时代的历史插曲，而是一件连续性的大事，要一直延伸至基督第二次降临之时。圣灵永远留在教会里，引导人们走向真理（若十四16）；基督是教会的头，作为头，他永远和身体连在一起。他带领身体，不是身体带领他。教会这基督的身体永远不会堕入背道叛教的罪孽，原因就在于此，只有个别的肢体会独立起来离开身体，堕入背道而导致属灵的死亡。即使教会的牧者，“从天落到地上的星”可能堕落背教，但是教会永远不会（宗二十30；得後二3；启九1；弟前三15）。永远有小群“余民”及信徒的余数和头连在一起，也永远有教会存在，因为根据基督的应许，即使“阴府之门”也不能胜过他（玛十六18）。
于是，教会是无与伦比的，不可见的（玛十六18）。她历经世代犹存，是“真理的柱石和根基”；真理建立在教会身上，而非教会建立在真理上。教会是真理，因为她的头是基督，即真理本身（弟前三15；若十四6）。没有基督，就没有教会（玛十六18），没有教会，就没有真理（弟前三15）。
由于教会也是可见的实体，它存在于许多世代，可以凭可见的象徵和标志辨认出来。这些外在的象徵，指明和验证了基督教会的身分，使之有别于自封的“教会”和矣谒。
这些标志是在信仰、组织和生活上遵照基督的旨意和宗徒的惯例而定，有著不可打破的连续性。教会连续性的最可见的焦点是宗徒传承。使徒统绪的源头在于圣经里所表达的上帝的旨意。早在五旬节以前，宗徒的职分就与众不同。使徒选出玛弟亚取代犹达斯担任“主教”，与旧约的预言相合（宗一26；咏一○八8）。这证明教会里存在著“主教”职分，所以宗徒要拣选合适的信徒，透过覆手将司祭的恩赐传递给他们（弟前四14；弟後一6），并且授命他们牧养地方教会，再在每一座城市按照所示的方式按立长老（司祭）和执事（辅祭）（宗十四23；弟後二2；弟前三8-12）。
所有这些教会牧者，都列入确保宗徒教训的纯洁与和谐的连续不断的宗徒传承之内“你们就应彼此意见一致，同气相爱，同心合意，思念同样的事，以满全我的喜乐”（斐二2）。正教教会具有宗徒教会这一切标志和特性，即：宗徒的教导和初期教会的全部神品结构，宗徒的训诲和精神。
正教教会知道大公教会在一个特定地方可以有两种不同的表现，即：修道院和堂区。教会的原始形式在正教的修道院保持完整，正如宗徒大事录所描述包括凡物公用（宗二42-47）。
教区的圣体血圣事，将堂区的集会转变为大公教会（格前十16-17），所赋予“堂区”一词的深层意义延伸至纯粹的地理涵义之外。由于“在教会里”的聚会（格前十16-17）就是基督之体，因此我们发现了教会的大公性。这表示出内在的（不是外在的或地理的）大公性；我们前面已经提过，保禄宗徒在格林多前书十一18-23如此表示说：“我听说你们聚会时，你们中间有分裂的事…轻视上帝的教会…这是我从主所领受的，我也传授给你们了：主耶稣在 被交付的那一夜，拿起饼来；祝谢了，擘开…”
使用在这里的教会一词，其动态意义等同于为了举行圣体血而聚集的格林多基督徒。每逢一个地区（堂区）的基督徒为这目的聚集一起，这集会就成为教会。在此所出现的是全教会，而不只是其中一部分（参罗十六23）。
信徒的整个生活超出其界限以外的事实，显示堂区的大公性。辖有许多神父的正教教区主教，确保基督临在于礼仪生活中，并护守信徒，使之以教会为首团结一致。圣洗圣事、圣膏圣事和所有的奥秘的圣事，都在堂区隆重举行。堂区信徒在教会聚集，每一位教友透过堂区都隶属大公教会。堂区和修道院一样，由于其内在的大公性，不是教会的一部分，而是整个教会。
堂区的信徒藉著他们参与圣体血圣事，蒙召在他们的日常生活上实践一个身体的经验；这也表现在事奉圣礼结束的劝诫中：“让我们在平安中离去”。“ 一个身体和一个圣灵…只有一个主，一个信德，一个洗礼；只有一个上帝和众人之父”这深深的合一与平安（弗四4-6）必须在信徒的每日生活上付之实践。有各种灵恩赐给他们每一个人。因此，每一个人在同一个教会的身体之内各有自己的功能，并且运用他的灵恩服务其他的肢体以及整个身体。他们蒙恩不是用于利己的（格前十二7-27；十四；十二26）。他们决不可离开弟兄而孤立，而应该用来服务身体，叫大家得益处（玛二十四45-51；二十五14-30；伯前四10-11）。当每一位信徒的整个属灵生命，以特定的礼仪集会作为中心来操练，达到融洽和谐的时候，这种奉献的可能就成为事实。
不幸在大城市大堂区里，人数众多的堂区信徒不再能够在“基督里合一”和“互为肢体”的架构之内发挥功能。教会必须解决这问题，并且寻找其他结构。不过，无论寻找到什么结构，都必须保护教会的宗徒徒组织要素，不可出自人意的创作，不用人的方法，尤其不可含有“今世”的标准和模式，以免使教会陷入世俗化。
宗徒教会的整个组织架构以事奉圣礼，也就是圣体血圣事作为中心，以保证教会真实性性的延续，也就是与元首基督有著不断的相通与联合，因为正如事奉圣礼的一篇祈祷文所说，他是“被分食而永不耗尽的”。这意思是新的架构不容许断绝与主教的相通，必须有牧者长老（司祭）与主教联合一起。因为主教代表基督的形像和地位，由主教按立的众长老（司祭团）代表宗徒议会。
初期教会主教安提约基亚的圣依纳爵作出上述声明，强调教会的合一，说主教在那里，信众就必须在那里；除非与主教联合一致，人们不可任意举行事奉圣礼。
与主教共融，全教会的合一才得以保持。每一位主教，必须隶属一个得到世界上所有其他正教主教议会承认的地方主教议会。如此，藉著地方议会，每一位主教与全世界所有的主教相联合。
按照初期的基督教传统，地方议会由国家首都的主教担任主席，并按如此的方式经过更普遍的决议和正教的承认产生自主的正教教会（宗主教区，总主教区，都主教区）。宗主教在各自治正教教会中拥有“荣誉的首席”，享有维系全体正教教会间的合一与合作的特殊使命的是君士坦丁堡的普世宗主教。全体正教教会在信仰和礼仪上合一，保持著原初教会的圣统结构。如果发生危及教会的信仰与生活的极端严重事件，由地方议会或更普遍的议会处理。
教会的整个组织结构以圣体血圣事的聚会为基础。因此不存在“金字塔形”的教阶结构。普世宗主教要和各地方教会的首脑建立关系，并且就全体而论，要和全体主教建立关系，是同侪中的首席。